A ce jour (3 avril 2012), l'inventaire des archives militaires de la guerre de Vendée conservées au Service historique de la Défense à Vincennes réunit trois fonds d'archives. Deux sont contemporains de la guerre de Vendée : la correspondance du ministère de la Guerre avec les armées de l'Ouest et les états de situation que ces mêmes armées ont adressées à leur ministère. Le troisième fonds date de la Restauration et contient des listes nominatives d'anciens combattants des armées royales dressées dans le cadre d'attribution de gratifications et de pensions.
Correspondance active et passive du ministère de la Guerre
La correspondance active et passive du ministère de la Guerre s'étend sur trois ans, entre mars 1793 et mars 1796. Les correspondants du ministère sont les militaires présents sur le terrain (généraux, commissaires des guerres, commandants des places et des bataillons), mais aussi des autorités civiles qu'elles soient nationales ou locales (Convention, Comité de salut public, représentants en mission, administrateurs des départements et des districts). Le fonds contient également des lettres échangées entre généraux, entre représentants en mission, ou entre une administration locale et un général.
L'ensemble est classé chronologiquement par armées. Celle de Réserve créée le 1er mars 1793 est transformée, dès le 30 avril, en armée des Côtes de La Rochelle. Le territoire de cette dernière va de l'embouchure de la Gironde jusqu'à celle de la Loire et comprend la rive droite de la Loire depuis Ingrande. Le 2 octobre 1793, l'armée des Côtes de La Rochelle, l'armée de Mayence et une partie de l'armée des Côtes de Brest sont réunies pour former l'armée de l'Ouest jusqu'en 1795. En parallèle, on suit sur des territoires plus au nord l'armée des Côtes puis, à l'issue de sa séparation en deux, l'armée des Côtes de Brest et celle des Côtes de Cherbourg. Enfin en 1795, l'armée de l'Ouest, l'armée des Côtes de Brest et l'armée des Côtes de Cherbourg fusionnent pour former l'armée des Côtes de l'Océan.
L'inventaire est très détaillé. Toutes les lettres sont analysées, les noms des correspondants indiqués, des citations sont parfois ajoutées. Les pièces sont réparties jour par jour dans un ordre géographique qui, le plus souvent, part de Paris, se rapproche du théâtre de la guerre (Tours, Chinon), puis le contourne par le sud (Saint-Maixent, Niort, Luçon), l'ouest (Les Sables-d'Olonne), et le nord (Nantes, Angers), avant de pénétrer au coeur du pays insurgé. A la fin du XIXe siècle, chaque pièce est accompagnée d'un bulletin analytique qui a été numérisé ici avant la pièce concernée. Ils existent aussi des bulletins isolés qui contiennent des analyses de transcriptions portées dans des registres de correspondance. Très nombreuses, les signatures autographes des auteurs des lettres ont été signalées par le signe ° qui suit les noms concernés. Enfin les cachets présentant un intérêt ont été numérisés en couleur et sont même représentés en une seule pièce recomposée lorsqu'ils sont brisés. Au total dix-huit cartons et douze registres de correspondance sont publiés, soit 8500 pièces numérisées en 20.000 vues.
Etats de situation
Placés en tête de l'inventaire, les états de situation livrent les effectifs des troupes républicaines mobilisées en Vendée. A ce jour (3 avril 2012), un carton comprenant 122 états de situation de l'armée de l'Ouest entre octobre 1793 et juin 1794 est publié (B 5/119). Sept autres le seront prochainement, toujours pour l'armée de l'Ouest jusqu'en décembre 1795, mais aussi pour l'armée des Côtes de Brest (mai 1793-sept. 1794) et pour celle des Côtes de l'Océan (janv.-mars 1796).
Pensions et gratifications attribuées aux anciens combattants des armées royales de l'Ouest
Sous la Restauration, les anciens combattants de la guerre de Vendée et des insurrections de 1799 et 1815 sont récompensés par l'attribution de pensions et de gratifications. Des états nominatifs sont dressés au niveau départemental, puis envoyés à Paris. Ils sont fort riches en information sur les personnes concernées ou leurs ayants droit : date et lieu de naissance, domicile, profession, état des services et blessures. Au début de la Monarchie de Juillet, les listes sont revues, et la conduite politique postérieure à la Révolution de 1830 peut alors faire l'objet de commentaire. Les états nominatifs se présentent sous forme de tableaux et ont été classés par corps des armées royales ou par département (départements de la Vendée militaire et départements bretons).
D'ici la fin de l'année 2012, l'inventaire sera enrichi par la publication des archives des commissions militaires associées aux armées de l'Ouest et par celle d'un ensemble de mémoires contemporains et postérieurs à la guerre de Vendée.